民國76年起隸屬於私立聯合工業專科學校,歷經改制,於民國88年成為「國立聯合技術學院」光電工程系。
本系於民國92年配合校名更動,改名為「國立聯合大學 光電工程學系」,並於民國96年開始招收碩士班學生,開啟碩士教育培育歷程。